San Carlos

Flora

En el bosque primario destacan especies arbóreas como el Guarumo, el Poroporo, la Ceiba, el Cedro Real. En la zona totalmente húmeda se encuentra el Ponpojoche, el Helequeme, el Guabo y el Papaturro, en el área pantanosa hay presencia de gramineas altas como el Zacatón, el Junca, el Platanillo, la Naranjela, de palmáceas como el Yolillo, la Palma casea, el Corozo y la Palma de aceite silvestre. En el espejo de agua proliferan especies acuáticas como la Lechuga de agua, el Lirio de agua y otras especies.

La situación del recurso forestal es muy crítica, el bosque latifoliado denso se encuentra reducido a pequeñas áreas (rodales) generalmente no mayores de 50 hectáreas, ubicadas en la parte sur del Río Papaturro, la zona sur - oriental del refugio cerca de Río Frío, se encuentra desprovista de su flora natural original y en difícil situación para su regeneración natural.

Las áreas de humedad comprenden una amplia gama de terrenos temporal o permanente, cubierto de árboles, palmáceas, gramíneas, leguminosas y demás plantas acuáticas emergentes o flotantes donde se genera, alberga, nutre y reproduce un inmenso sustrato micro orgánico, que mueve la cadena alimenticia que se hace obvia en la diversidad material y funcional de aves, reptiles, anfibios, mamíferos y peces.

Fauna

Entre las aves existe gran número de especies (más de 270), siendo las más comunes las Garzas, los Patos y Martín pescador, entre los reptiles destacan el Cuajipal y el lagarto negro, varios géneros de tortugas de agua dulce, iguanas, garrobos, barselicos, lagartijas, y reptiles, entre los anfibios, las ranas. Dentro de los mamíferos, se encuentra el Venado, Tepeizcuintes o guardatinajas, cusucos o armadillos, cerdo de monte o zahino, pizote, perezoso, monos congos, oso hormiguero, nutria o perro de agua, guatusa murciélagos, los felinos (jaguar y canelo), se encuentran en peligro de extinción. La ictiofauna (peces), comprende el Gaspar ( el más abundante), guapotes, mojarras, guabinas, róbalos, machacas, roncador y últimamente tilapias.